Стоит помнить, что Токио - это мегаполис, а значит по нему не получится кататься, используя только один вид транспорта. Хоть и метро в Токио спроектировано таким образом, чтобы человеку легко было добраться в разные районы города, но тем не менее пересадки делать придется и использовать автобусы, трамваи также.
Да, метро в Токио можно считать самым быстрым и удобным способом передвижения. Как и в любом другом городе, где есть метро. Но советую не ездить в токийском метро в час пик - очень много людей в это время, больше чем в Москве даже.